粘質沙雷氏菌幾丁質酶(ChiC)基因克隆及其生物信息學分析

從粘質沙雷氏菌(Serratia marcescens ATCC14041)中克隆出幾丁質酶基因(ChiC),將回收純化的PCR產物與載體pMD18-T連接,構建成的重組質粒命名為pMD-ChiC,將重組質粒轉化到受體E.coli DH5α中進行克隆,經BamHⅠ和Nhe Ⅰ雙酶切驗證、核酸序列測定證實,重組質粒pMD-ChiC含有幾丁質酶C基因(ChiC).利用生物信息學的方法,推測該粘質沙雷氏菌ChiC基因編碼的蛋白質由480個氨基酸組成.預測該蛋白的等電點為5.63,分子量約為52kD.針對粘質沙雷氏菌中的幾個幾丁質酶基因做了進化樹,進而驗證了粘質沙雷氏菌(Serratia marcescens)幾丁質酶(ChiC)在沙雷氏菌幾丁質酶中的分類;同時對粘質沙雷氏菌幾丁質酶C(ChiC)蛋白的高級結構作出了預測,得到其編碼的屬于18家族的蛋白質高級結構圖譜.

作 者： 魏巍 賀淹才 方柏山 劉愛花 WEI Wei HE Yan-cai FANG Bai-shan LIU Ai-hua   作者單位： 華僑大學,生物工程系,福建,泉州,362021  刊 名： 江西農業大學學報  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA AGRICULTURAE UNIVERSITATIS JIANGXIENSIS  年，卷(期)： 2006 28(3)  分類號： Q813.2  關鍵詞： 幾丁質酶ChiC基因   粘質沙雷氏菌   基因克隆   生物信息學分析  

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