仿刺參的微衛星標記

為了評價種質資源及基礎生物學研究的需要,本文開發了仿刺參的微衛星標記.NCBI數據庫中共有20個含有仿刺參微衛星的序列,從中選取8個設計引物,發現6個微衛星位點有多態性.不同的引物獲得的等位基因數為3～9個不等,6個位點共獲得了31個等位基因,每個位點平均獲得5.2個等位基因.6個位點的平均觀測雜合度(Ho)為0.3611,平均期望雜合度(He)為0.6402.位點AJMS004提供的多態性信息含量值較低,為0.4862;其他5個位點均在0.5以上.另外,還嘗試了紅海參(Parastichopus californicus)微衛星標記在仿刺參的通用性.實驗結果表明,在較高的退火溫度下,5對引物均能擴增仿刺參的基因組DNA并具多態性.5個位點共獲得了22個等位基因,每個位點平均獲得4.4個等位基因.5個位點的平均觀測雜合度(Ho)為0.1733,平均期望雜合度(He)為0.4201.其中位點Psc 2的多態性信息含量值最高,為0.8500.

作 者： 戰愛斌 包振民 陸維 汪小龍 胡景杰 ZHAN Ai-bin BAO Zhen-min LU Wei WANG Xiao-long HU Jing-jie   作者單位： 戰愛斌,ZHAN Ai-bin(中國海洋大學生命科學與技術學部海洋生物遺傳與種質工程實驗室,山東,青島,266003;中國海洋大學海水養殖教育部重點實驗室,山東,青島,266003)

包振民,陸維,汪小龍,胡景杰,BAO Zhen-min,LU Wei,WANG Xiao-long,HU Jing-jie(中國海洋大學生命科學與技術學部海洋生物遺傳與種質工程實驗室,山東,青島,266003) 

刊 名： 水產學報  ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA  年，卷(期)： 2006 30(2)  分類號： S917  關鍵詞： 仿刺參   微衛星標記   多態性   通用性  

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